Не формируется напряжение для заряда батарей. вместо ~27.6В идёт ~13.8В. Замена IC18,IC19,IC21 ничего не дала.

IC21 не формирует импульсы на выводах 3,4,6,7

Кто такое ремонтировал ?

Может быть два варианта: или порц запретил ЗУ по цифре или аналоговой в обратной связи что-то оборвалось или коротит.
АЦП правильно измеряет батарею?

АЦП измеряет правильно и пишет ~13.8 В что и было реально измерено на АКБ.

Проверьте работу аналоговой части ЗУ, это 13-14 ноги ИС21 и СМД детали вокруг них, поз обозн см. по схеме. попробуйте коротнуть на корпус 13 ногу и посмотрите появляется-ли зарядка. Скорее всего резистор какой-то оборвался или конденсатор течет в этой цепи. Был похожий случай, но в обратную сторону, не останавливался заряд по аналогу, тормозила цифра с индикацией аварии.