Если напряжение на батареях разное, алгоритм таков:

Замерить напряжение на клеммах аккумуляторов батареи, если оно одинаковое (разница не превышает 0.02V), то нагрузить ИБП на нагрузку в 70% от номинала, переключить на батареи и промерять напряжение от минусовой клеммы батареи до земли платы ИБП и от плюсового вывода батареи до плюса самого большого электролитического конденсатора на плате, потом проверить напряжение между клеммами аккумуляторов соединенных в батарею перемычками. Напряжение на этих участках должно быть не более 0.02В Если оно больше, требуется как минимум зачистить и затянуть клеммы, а как максимум - заменить или переобжать их.

Если клеммы в норме, а батареи все равно имеют разное напряжение, требуется проверить напряжение заряда. Оно не должно превышать 13.8V на 12V аккумулятор, а в идеале должно быть 13.6V. По любому, конеченое напряжение заряда выше 13.8 и ниже 13.2 есть повод к починке и настройке схемы зарядки батарей.

Если напряжение в норме, проведите выравнивающий цикл разряда, нагрузите ИБП на 10% нагрузки и разрядите-зарядите 2-3 раза. (разряд, автовыключение, час паузы, сутки заряда и так далее)

Если напряжение останется разным, то проведите замер напряжения на аккумуляторах при разрядке батареи до критического уровня, разница напряжений не должна превышать 1V. Если превышает - выкиньте батарею на которой напряжение под нагрузкой меньше, у нее проблема с одной из банок.

Далее следует удостоверится в том, что батареи одной фирмы-емкости и партии (номер партии обычно на корпусе или написан или выплавлен или выштампован (такой кружок-циферблат) со стрелкой. Если разные - купите одинаковые.

Если батареи одинаковые, значит качество их исполнения крайне невысокое - купите батареи более внушающего доверия производителя.