Все же проблема была немного иной, видимо при переходе на некоторое значение HEX Code обратное возвращение на корректное значение уже не возможно из APCFix.

Слив дампа с EEPROM рабочего ИБП и заливка на EEPROM нерабочего решили все проблемы. Сливать можно не выпаивая прищепкой. Залить без выпаивания не получилось. При первом включении ИБП не хотел выдавать на выход какое-либо напряжение, после полной перезагрузки все пришло в норму.